虽然麻黄素滴鼻液在缓解鼻塞时可起到立竿见影的疗效，但是随着药理学研究的深入，麻黄素的副作用昭然若揭，使我们不得不重新权衡它的利弊：
首先，麻黄素是α及β受体兴奋剂，对心脏和中枢神经系统副作用较多，因此高血压、冠心病、甲状腺机能亢进、青光眼、前列腺肥大的患者应慎用。
其次，麻黄素对心脏有兴奋作用，长期使用，会产生抑制，也可影响心率。特别是与洋地黄合用时，会加剧洋地黄对心脏的作用，易引起心率失常。
第三，如果长期滥用麻黄素，仍会造成逆转反应，继发性血管扩张，产生对药物的依赖性，日久形成药物性鼻炎。此外，个别患者对麻黄碱过敏，滴鼻后可引起鼻、咽、喉的过敏反应，甚至震颤、心悸、失眠、焦虑等全身不适。
正是麻黄素滴鼻液的弊多利少，国外早在六十年代就开始限制麻黄素局部减充血剂的使用。国内鼻科专家也于今年提出“关于限制滥用麻黄素类鼻腔减充血剂的建议”。
