藏污纳垢容易引起泌尿生殖炎症。包皮富含皮脂腺和大量分泌物。包皮使分泌物无法排出，并积聚成垢并寄生许多致病菌。细菌侵入尿道可引起尿路感染、包皮炎、龟头炎、尿道炎，增加生殖器疣、疱疹等性疾病的感染概率。
导致阳痿早泄、男性不育其他疾病，由于龟头粘膜通常刺激较少，使龟头粘膜神经感觉过于敏感，龟头和阴道摩擦触摸泄漏，产生性交疼痛等。
还因早泄、炎症、阳痿、不射精降低精子活性和精液粘度导致不孕。
男性包皮垢(残留尿液结晶)是女性宫颈癌的重要原因，危害女性生殖健康和疾病康复。包皮垢中含有各种细菌，在性生活中带入阴道，导致女性妇科疾病反复感染长期治愈、刺激子宫、诱发宫颈癌是女性宫颈恶变的重要原因。
损害肾功能，诱发癌症，因炎症引起尿道口或前尿道狭窄影响尿代谢，包皮细菌感染肾脏，长期会损害肾功能。研究表明，包皮垢是一种致癌物，是导致男性阴茎癌的因素之一。
影响阴茎长度和直径的发育：外国包皮切除术在儿童3岁左右进行。主要是因为在青春期，由于阴茎头被包皮紧紧包裹，没有受到外界的刺激，阴茎的发育受到约束，导致阴茎头冠直径小。
