临床上对于男性急性前列腺炎的发病原因尚不明确。可能与细菌感染、真菌感染等因素有关，也可能和某些非性病性病原体感染、淋菌性尿道炎相关。患者还可能存在医源性的因素。
一、细菌感染
1.革兰阴性杆菌：常见于大肠埃希菌、克雷伯菌属及变形杆菌属等，常由尿路逆行至前列腺而引起炎症反应。
2.金黄色葡萄球菌：常见于慢性细菌性前列腺炎患者的致病微生物，可能是由于长期应用广谱抗菌药导致耐药菌株繁殖所造成。
3.其他革兰阳性球菌：如链球菌属及流感嗜血杆菌等也可引起急性前列腺炎，但相对少见。
4.假单胞菌属：主要见于医院获得性的急性前列腺炎，是临床常见的致病菌之一。
二、真菌感染
常见于念珠菌引起的非特异性感染，通常继发于机体免疫功能低下或有基础疾病时。
三、非性病性病原体感染
包括各种病原体，如支原体、衣原体、滴虫、包皮垢及皮肤感染灶等均可引起急性前列腺炎。
四、淋菌性尿道炎相关
部分淋菌性尿道炎相关的急性前列腺炎可继发于不洁性行为后，少数情况下也可因配偶一方发生淋菌性尿道炎而通过非性接触传染所致。
五、医源性的因素
主要包括导尿以及留置导尿管、膀胱镜检查、经直肠穿刺前列腺液检查以及接受治疗使用抗生素药物等情况，在这些医疗操作过程中如果消毒不严格或者术中无菌操作不规范，则可能会引起医源性感染而导致急性前列腺炎的发生。
